Protein–RNA interactions for Protein: Q06149

PDR8, Transcription factor PDR8, yeastyeast

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR8Q06149 RPL26BYGR034W 384 nt1.18□□□□□ -2.22
PDR8Q06149 KAP120YPL125W 3099 nt1.16□□□□□ -2.22
PDR8Q06149 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.16□□□□□ -2.22
PDR8Q06149 VAM6YDL077C 3150 nt1.15□□□□□ -2.22
PDR8Q06149 YML002WYML002W 2214 nt1.15□□□□□ -2.23
PDR8Q06149 snR190snR190 190 nt1.15□□□□□ -2.23
PDR8Q06149 YGR130CYGR130C 2451 nt1.14□□□□□ -2.23
PDR8Q06149 YGR164WYGR164W 336 nt1.14□□□□□ -2.23
PDR8Q06149 UTP8YGR128C 2142 nt1.13□□□□□ -2.23
PDR8Q06149 YGL182CYGL182C 324 nt1.13□□□□□ -2.23
PDR8Q06149 YNL170WYNL170W 396 nt1.13□□□□□ -2.23
PDR8Q06149 YOR102WYOR102W 351 nt1.13□□□□□ -2.23
PDR8Q06149 SDH6YDR379C-A 240 nt1.12□□□□□ -2.23
PDR8Q06149 SNU13YEL026W 381 nt1.12□□□□□ -2.23
PDR8Q06149 YLR041WYLR041W 321 nt1.12□□□□□ -2.23
PDR8Q06149 snR48snR48 113 nt1.12□□□□□ -2.23
PDR8Q06149 FYV10YIL097W 1551 nt1.11□□□□□ -2.23
PDR8Q06149 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.1□□□□□ -2.23
PDR8Q06149 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.1□□□□□ -2.23
PDR8Q06149 PRP16YKR086W 3216 nt1.1□□□□□ -2.23
PDR8Q06149 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.09□□□□□ -2.23
PDR8Q06149 SIP4YJL089W 2490 nt1.08□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 TAH1YCR060W 336 nt1.08□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 YPR117WYPR117W 7470 nt1.08□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 SEC8YPR055W 3198 nt1.07□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 DOP1YDR141C 5097 nt1.07□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.07□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 IML1YJR138W 4755 nt1.07□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 SCC2YDR180W 4482 nt1.06□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.05□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.04□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.04□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 CHS6YJL099W 2241 nt1.04□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.03□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.03□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.03□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.03□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.03□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 YLR232WYLR232W 348 nt1.03□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 BEM2YER155C 6504 nt1.03□□□□□ -2.24
PDR8Q06149 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.01□□□□□ -2.25
PDR8Q06149 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1□□□□□ -2.25
PDR8Q06149 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1□□□□□ -2.25
PDR8Q06149 SPT7YBR081C 3999 nt0.99□□□□□ -2.25
PDR8Q06149 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt0.98□□□□□ -2.25
PDR8Q06149 YDR544CYDR544C 429 nt0.97□□□□□ -2.25
PDR8Q06149 UBP3YER151C 2739 nt0.97□□□□□ -2.25
PDR8Q06149 YDL073WYDL073W 2955 nt0.96□□□□□ -2.26
PDR8Q06149 QCR9YGR183C 201 nt0.94□□□□□ -2.26
PDR8Q06149 snR39BsnR39B 96 nt0.94□□□□□ -2.26
PDR8Q06149 RKR1YMR247C 4689 nt0.92□□□□□ -2.26
PDR8Q06149 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.92□□□□□ -2.26
PDR8Q06149 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.92□□□□□ -2.26
PDR8Q06149 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.92□□□□□ -2.26
PDR8Q06149 YSP1YHR155W 3687 nt0.92□□□□□ -2.26
PDR8Q06149 OST4YDL232W 111 nt0.91□□□□□ -2.26
PDR8Q06149 COG6YNL041C 2520 nt0.91□□□□□ -2.26
PDR8Q06149 RPM2YML091C 3609 nt0.9□□□□□ -2.27
PDR8Q06149 BEM3YPL115C 3387 nt0.9□□□□□ -2.27
PDR8Q06149 YJR029WYJR029W 5268 nt0.89□□□□□ -2.27
PDR8Q06149 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.89□□□□□ -2.27
PDR8Q06149 BUD3YCL014W 4911 nt0.88□□□□□ -2.27
PDR8Q06149 SEC1YDR164C 2175 nt0.87□□□□□ -2.27
PDR8Q06149 YDR210WYDR210W 228 nt0.86□□□□□ -2.27
PDR8Q06149 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.85□□□□□ -2.27
PDR8Q06149 PAU24YBR301W 363 nt0.85□□□□□ -2.27
PDR8Q06149 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.84□□□□□ -2.27
PDR8Q06149 SOM1YEL059C-A 225 nt0.83□□□□□ -2.28
PDR8Q06149 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.83□□□□□ -2.28
PDR8Q06149 ULP2YIL031W 3105 nt0.82□□□□□ -2.28
PDR8Q06149 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.82□□□□□ -2.28
PDR8Q06149 Q0143Q0143 153 nt0.82□□□□□ -2.28
PDR8Q06149 STF2YGR008C 255 nt0.81□□□□□ -2.28
PDR8Q06149 GLG1YKR058W 1851 nt0.8□□□□□ -2.28
PDR8Q06149 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.79□□□□□ -2.28
PDR8Q06149 HUG1YML058W-A 207 nt0.79□□□□□ -2.28
PDR8Q06149 NNF2YGR089W 2811 nt0.78□□□□□ -2.28
PDR8Q06149 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.78□□□□□ -2.28
PDR8Q06149 YBR099CYBR099C 384 nt0.78□□□□□ -2.28
PDR8Q06149 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.74□□□□□ -2.29
PDR8Q06149 BUL2YML111W 2763 nt0.74□□□□□ -2.29
PDR8Q06149 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.73□□□□□ -2.29
PDR8Q06149 YNL205CYNL205C 423 nt0.73□□□□□ -2.29
PDR8Q06149 NIP1YMR309C 2439 nt0.72□□□□□ -2.29
PDR8Q06149 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.71□□□□□ -2.3
PDR8Q06149 BIR1YJR089W 2865 nt0.7□□□□□ -2.3
PDR8Q06149 snR85snR85 171 nt0.7□□□□□ -2.3
PDR8Q06149 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.69□□□□□ -2.3
PDR8Q06149 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.69□□□□□ -2.3
PDR8Q06149 LTE1YAL024C 4308 nt0.69□□□□□ -2.3
PDR8Q06149 PET111YMR257C 2403 nt0.68□□□□□ -2.3
PDR8Q06149 PMP2YEL017C-A 132 nt0.66□□□□□ -2.3
PDR8Q06149 RPS26AYGL189C 360 nt0.66□□□□□ -2.3
PDR8Q06149 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.66□□□□□ -2.3
PDR8Q06149 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.66□□□□□ -2.3
PDR8Q06149 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.66□□□□□ -2.3
PDR8Q06149 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.66□□□□□ -2.3
PDR8Q06149 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
PDR8Q06149 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
PDR8Q06149 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.66□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.2 ms