Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPN12Q05209 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN12Q05209 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms