Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUCB1Q02818 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms