Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSG1Q02413 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG1Q02413 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms