Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDR2Q01850 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDR2Q01850 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDR2Q01850 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDR2Q01850 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDR2Q01850 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDR2Q01850 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDR2Q01850 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDR2Q01850 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDR2Q01850 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDR2Q01850 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDR2Q01850 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDR2Q01850 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDR2Q01850 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDR2Q01850 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDR2Q01850 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDR2Q01850 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDR2Q01850 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDR2Q01850 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDR2Q01850 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDR2Q01850 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDR2Q01850 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDR2Q01850 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDR2Q01850 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDR2Q01850 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDR2Q01850 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDR2Q01850 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDR2Q01850 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDR2Q01850 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDR2Q01850 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDR2Q01850 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDR2Q01850 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDR2Q01850 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDR2Q01850 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDR2Q01850 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDR2Q01850 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDR2Q01850 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CDR2Q01850 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDR2Q01850 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDR2Q01850 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDR2Q01850 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDR2Q01850 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDR2Q01850 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDR2Q01850 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDR2Q01850 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms