Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2C1P98194 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2C1P98194 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms