Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN10P78369 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms