Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC1P78348 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms