Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-21P61565 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-21P61565 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-21P61565 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-21P61565 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-21P61565 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-21P61565 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-21P61565 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-21P61565 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-21P61565 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-21P61565 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-21P61565 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-21P61565 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-21P61565 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-21P61565 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-21P61565 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-21P61565 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-21P61565 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-21P61565 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-21P61565 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-21P61565 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-21P61565 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-21P61565 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-21P61565 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-21P61565 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-21P61565 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-21P61565 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVK-21P61565 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms