Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP11P59045 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms