Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BACE1P56817 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BACE1P56817 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BACE1P56817 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BACE1P56817 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BACE1P56817 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BACE1P56817 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BACE1P56817 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BACE1P56817 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BACE1P56817 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BACE1P56817 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BACE1P56817 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BACE1P56817 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BACE1P56817 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BACE1P56817 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BACE1P56817 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BACE1P56817 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BACE1P56817 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BACE1P56817 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BACE1P56817 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BACE1P56817 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BACE1P56817 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BACE1P56817 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BACE1P56817 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BACE1P56817 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BACE1P56817 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BACE1P56817 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BACE1P56817 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BACE1P56817 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BACE1P56817 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BACE1P56817 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BACE1P56817 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BACE1P56817 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BACE1P56817 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BACE1P56817 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BACE1P56817 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BACE1P56817 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BACE1P56817 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BACE1P56817 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BACE1P56817 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BACE1P56817 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BACE1P56817 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BACE1P56817 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BACE1P56817 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BACE1P56817 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BACE1P56817 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BACE1P56817 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BACE1P56817 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BACE1P56817 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BACE1P56817 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BACE1P56817 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BACE1P56817 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BACE1P56817 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BACE1P56817 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BACE1P56817 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BACE1P56817 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BACE1P56817 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms