Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms