Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1P56182 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1P56182 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1P56182 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1P56182 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1P56182 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1P56182 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1P56182 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1P56182 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1P56182 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1P56182 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1P56182 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1P56182 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1P56182 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1P56182 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1P56182 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP1P56182 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP1P56182 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP1P56182 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP1P56182 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1P56182 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1P56182 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1P56182 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1P56182 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1P56182 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1P56182 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1P56182 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1P56182 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1P56182 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1P56182 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1P56182 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1P56182 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1P56182 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP1P56182 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms