Protein–RNA interactions for Protein: P53976

YNL018C, Uncharacterized protein YNL018C, yeastyeast

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL018CP53976 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.41□□□□□ -2.18
YNL018CP53976 POL5YEL055C 3069 nt1.4□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.4□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 CMC4YMR194C-B 222 nt1.4□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 YNL205CYNL205C 423 nt1.39□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 TRM732YMR259C 4263 nt1.39□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 COX5BYIL111W 456 nt1.38□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 NOP9YJL010C 2001 nt1.37□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 STB6YKL072W 2301 nt1.37□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 YLR282CYLR282C 342 nt1.37□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 BFR2YDR299W 1605 nt1.37□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 YGL182CYGL182C 324 nt1.36□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 YML002WYML002W 2214 nt1.35□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.35□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.35□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.35□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.35□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 RAD9YDR217C 3930 nt1.35□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 PET127YOR017W 2403 nt1.35□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 snR85snR85 171 nt1.34□□□□□ -2.19
YNL018CP53976 CHS6YJL099W 2241 nt1.34□□□□□ -2.2
YNL018CP53976 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt1.33□□□□□ -2.2
YNL018CP53976 RPL26BYGR034W 384 nt1.32□□□□□ -2.2
YNL018CP53976 HKR1YDR420W 5409 nt1.32□□□□□ -2.2
YNL018CP53976 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.31□□□□□ -2.2
YNL018CP53976 snR190snR190 190 nt1.31□□□□□ -2.2
YNL018CP53976 TAH1YCR060W 336 nt1.3□□□□□ -2.2
YNL018CP53976 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.3□□□□□ -2.2
YNL018CP53976 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.3□□□□□ -2.2
YNL018CP53976 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.3□□□□□ -2.2
YNL018CP53976 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.3□□□□□ -2.2
YNL018CP53976 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.3□□□□□ -2.2
YNL018CP53976 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.3□□□□□ -2.2
YNL018CP53976 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.3□□□□□ -2.2
YNL018CP53976 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.3□□□□□ -2.2
YNL018CP53976 FYV10YIL097W 1551 nt1.3□□□□□ -2.2
YNL018CP53976 FYV8YGR196C 2454 nt1.29□□□□□ -2.2
YNL018CP53976 SIP4YJL089W 2490 nt1.29□□□□□ -2.2
YNL018CP53976 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.27□□□□□ -2.21
YNL018CP53976 UBP3YER151C 2739 nt1.26□□□□□ -2.21
YNL018CP53976 KAP120YPL125W 3099 nt1.26□□□□□ -2.21
YNL018CP53976 NST1YNL091W 3723 nt1.26□□□□□ -2.21
YNL018CP53976 UTP20YBL004W 7482 nt1.26□□□□□ -2.21
YNL018CP53976 CDC39YCR093W 6327 nt1.25□□□□□ -2.21
YNL018CP53976 YLR041WYLR041W 321 nt1.24□□□□□ -2.21
YNL018CP53976 YLR232WYLR232W 348 nt1.23□□□□□ -2.21
YNL018CP53976 BUD3YCL014W 4911 nt1.23□□□□□ -2.21
YNL018CP53976 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.22□□□□□ -2.21
YNL018CP53976 PRP16YKR086W 3216 nt1.21□□□□□ -2.22
YNL018CP53976 ASE1YOR058C 2658 nt1.21□□□□□ -2.22
YNL018CP53976 YDR544CYDR544C 429 nt1.21□□□□□ -2.22
YNL018CP53976 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.2□□□□□ -2.22
YNL018CP53976 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.19□□□□□ -2.22
YNL018CP53976 OST4YDL232W 111 nt1.19□□□□□ -2.22
YNL018CP53976 YBR099CYBR099C 384 nt1.19□□□□□ -2.22
YNL018CP53976 SEC8YPR055W 3198 nt1.19□□□□□ -2.22
YNL018CP53976 SOM1YEL059C-A 225 nt1.18□□□□□ -2.22
YNL018CP53976 snR39BsnR39B 96 nt1.18□□□□□ -2.22
YNL018CP53976 SCC2YDR180W 4482 nt1.18□□□□□ -2.22
YNL018CP53976 BEM3YPL115C 3387 nt1.17□□□□□ -2.22
YNL018CP53976 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt1.16□□□□□ -2.22
YNL018CP53976 YPR117WYPR117W 7470 nt1.16□□□□□ -2.22
YNL018CP53976 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.15□□□□□ -2.23
YNL018CP53976 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.14□□□□□ -2.23
YNL018CP53976 BEM2YER155C 6504 nt1.14□□□□□ -2.23
YNL018CP53976 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.13□□□□□ -2.23
YNL018CP53976 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.12□□□□□ -2.23
YNL018CP53976 YDL073WYDL073W 2955 nt1.12□□□□□ -2.23
YNL018CP53976 LTE1YAL024C 4308 nt1.11□□□□□ -2.23
YNL018CP53976 PMP2YEL017C-A 132 nt1.11□□□□□ -2.23
YNL018CP53976 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.11□□□□□ -2.23
YNL018CP53976 SPT7YBR081C 3999 nt1.1□□□□□ -2.23
YNL018CP53976 YOL014WYOL014W 375 nt1.1□□□□□ -2.23
YNL018CP53976 COG6YNL041C 2520 nt1.09□□□□□ -2.23
YNL018CP53976 YDR210WYDR210W 228 nt1.09□□□□□ -2.23
YNL018CP53976 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.09□□□□□ -2.23
YNL018CP53976 DOP1YDR141C 5097 nt1.07□□□□□ -2.24
YNL018CP53976 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt1.04□□□□□ -2.24
YNL018CP53976 YSP1YHR155W 3687 nt1.04□□□□□ -2.24
YNL018CP53976 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.02□□□□□ -2.25
YNL018CP53976 SEC1YDR164C 2175 nt1.01□□□□□ -2.25
YNL018CP53976 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt1.01□□□□□ -2.25
YNL018CP53976 TFB5YDR079C-A 219 nt1□□□□□ -2.25
YNL018CP53976 YMR160WYMR160W 2451 nt1□□□□□ -2.25
YNL018CP53976 BIR1YJR089W 2865 nt0.99□□□□□ -2.25
YNL018CP53976 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt0.98□□□□□ -2.25
YNL018CP53976 snR61snR61 90 nt0.97□□□□□ -2.25
YNL018CP53976 YBL109WYBL109W 336 nt0.97□□□□□ -2.25
YNL018CP53976 YJR029WYJR029W 5268 nt0.97□□□□□ -2.25
YNL018CP53976 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.97□□□□□ -2.25
YNL018CP53976 GLG1YKR058W 1851 nt0.97□□□□□ -2.25
YNL018CP53976 VAM6YDL077C 3150 nt0.96□□□□□ -2.26
YNL018CP53976 RKR1YMR247C 4689 nt0.95□□□□□ -2.26
YNL018CP53976 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.95□□□□□ -2.26
YNL018CP53976 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.95□□□□□ -2.26
YNL018CP53976 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
YNL018CP53976 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.95□□□□□ -2.26
YNL018CP53976 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.95□□□□□ -2.26
YNL018CP53976 YMR326CYMR326C 309 nt0.93□□□□□ -2.26
YNL018CP53976 YNL266WYNL266W 420 nt0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57 ms