Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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PGGT1BP53609 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PGGT1BP53609 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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PGGT1BP53609 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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PGGT1BP53609 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PGGT1BP53609 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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