Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOSBP53539 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOSBP53539 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOSBP53539 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOSBP53539 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOSBP53539 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOSBP53539 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOSBP53539 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOSBP53539 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOSBP53539 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOSBP53539 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOSBP53539 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOSBP53539 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOSBP53539 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOSBP53539 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOSBP53539 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOSBP53539 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOSBP53539 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOSBP53539 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOSBP53539 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOSBP53539 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOSBP53539 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOSBP53539 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOSBP53539 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOSBP53539 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOSBP53539 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOSBP53539 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOSBP53539 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOSBP53539 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOSBP53539 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOSBP53539 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms