Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARFIP1P53367 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms