Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP98P52948 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP98P52948 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP98P52948 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP98P52948 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP98P52948 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP98P52948 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP98P52948 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP98P52948 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUP98P52948 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUP98P52948 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP98P52948 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP98P52948 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP98P52948 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP98P52948 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP98P52948 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP98P52948 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP98P52948 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP98P52948 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP98P52948 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP98P52948 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP98P52948 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP98P52948 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP98P52948 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP98P52948 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP98P52948 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP98P52948 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP98P52948 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP98P52948 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP98P52948 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP98P52948 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP98P52948 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP98P52948 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP98P52948 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP98P52948 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP98P52948 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP98P52948 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP98P52948 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP98P52948 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP98P52948 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP98P52948 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP98P52948 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP98P52948 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP98P52948 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP98P52948 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP98P52948 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP98P52948 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP98P52948 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP98P52948 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP98P52948 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP98P52948 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP98P52948 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP98P52948 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP98P52948 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP98P52948 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP98P52948 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP98P52948 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP98P52948 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP98P52948 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP98P52948 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP98P52948 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP98P52948 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP98P52948 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP98P52948 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP98P52948 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP98P52948 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP98P52948 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP98P52948 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP98P52948 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP98P52948 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP98P52948 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP98P52948 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP98P52948 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP98P52948 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP98P52948 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP98P52948 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP98P52948 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP98P52948 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP98P52948 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP98P52948 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms