Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REG1BP48304 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
REG1BP48304 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
REG1BP48304 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
REG1BP48304 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
REG1BP48304 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
REG1BP48304 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
REG1BP48304 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms