Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC5P40937 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFC5P40937 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFC5P40937 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFC5P40937 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC5P40937 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC5P40937 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC5P40937 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC5P40937 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC5P40937 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC5P40937 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC5P40937 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC5P40937 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC5P40937 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC5P40937 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms