Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEACAM3P40198 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CEACAM3P40198 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms