Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP62P37198 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP62P37198 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP62P37198 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP62P37198 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP62P37198 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP62P37198 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP62P37198 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NUP62P37198 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NUP62P37198 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NUP62P37198 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NUP62P37198 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NUP62P37198 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUP62P37198 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUP62P37198 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUP62P37198 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms