Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH11P35749 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH11P35749 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH11P35749 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH11P35749 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH11P35749 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH11P35749 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH11P35749 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH11P35749 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH11P35749 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH11P35749 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYH11P35749 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MYH11P35749 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MYH11P35749 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MYH11P35749 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MYH11P35749 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYH11P35749 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYH11P35749 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYH11P35749 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYH11P35749 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MYH11P35749 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYH11P35749 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYH11P35749 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYH11P35749 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYH11P35749 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MYH11P35749 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYH11P35749 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYH11P35749 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYH11P35749 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYH11P35749 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYH11P35749 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYH11P35749 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYH11P35749 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms