Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMLP26374 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMLP26374 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMLP26374 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMLP26374 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMLP26374 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMLP26374 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMLP26374 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMLP26374 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMLP26374 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMLP26374 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMLP26374 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMLP26374 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMLP26374 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMLP26374 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMLP26374 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMLP26374 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMLP26374 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMLP26374 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMLP26374 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMLP26374 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMLP26374 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMLP26374 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMLP26374 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMLP26374 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMLP26374 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMLP26374 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMLP26374 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMLP26374 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMLP26374 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMLP26374 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMLP26374 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMLP26374 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMLP26374 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMLP26374 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMLP26374 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMLP26374 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMLP26374 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMLP26374 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMLP26374 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMLP26374 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMLP26374 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMLP26374 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMLP26374 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMLP26374 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMLP26374 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMLP26374 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMLP26374 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMLP26374 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMLP26374 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMLP26374 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMLP26374 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMLP26374 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMLP26374 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMLP26374 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMLP26374 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMLP26374 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMLP26374 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMLP26374 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMLP26374 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMLP26374 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMLP26374 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMLP26374 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMLP26374 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMLP26374 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMLP26374 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMLP26374 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMLP26374 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMLP26374 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMLP26374 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMLP26374 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMLP26374 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMLP26374 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMLP26374 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMLP26374 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMLP26374 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMLP26374 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms