Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE1P24864 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE1P24864 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms