Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms