Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4AP20648 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4AP20648 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms