Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD1P17405 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms