Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTLA4P16410 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms