Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFMP07197 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFMP07197 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFMP07197 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFMP07197 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFMP07197 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFMP07197 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFMP07197 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFMP07197 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFMP07197 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFMP07197 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFMP07197 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFMP07197 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFMP07197 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFMP07197 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFMP07197 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFMP07197 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFMP07197 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFMP07197 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFMP07197 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NEFMP07197 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEFMP07197 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEFMP07197 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEFMP07197 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEFMP07197 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFMP07197 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFMP07197 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFMP07197 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFMP07197 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFMP07197 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFMP07197 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFMP07197 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFMP07197 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFMP07197 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFMP07197 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFMP07197 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFMP07197 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFMP07197 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFMP07197 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFMP07197 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEFMP07197 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms