Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASS1P00966 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASS1P00966 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASS1P00966 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASS1P00966 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASS1P00966 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASS1P00966 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASS1P00966 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASS1P00966 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASS1P00966 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ASS1P00966 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASS1P00966 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASS1P00966 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASS1P00966 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASS1P00966 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASS1P00966 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASS1P00966 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ASS1P00966 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASS1P00966 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASS1P00966 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASS1P00966 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASS1P00966 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ASS1P00966 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASS1P00966 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASS1P00966 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASS1P00966 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASS1P00966 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASS1P00966 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASS1P00966 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASS1P00966 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASS1P00966 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASS1P00966 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms