Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SURF6O75683 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SURF6O75683 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SURF6O75683 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SURF6O75683 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SURF6O75683 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SURF6O75683 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SURF6O75683 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SURF6O75683 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF6O75683 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF6O75683 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF6O75683 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF6O75683 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF6O75683 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF6O75683 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF6O75683 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF6O75683 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF6O75683 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF6O75683 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF6O75683 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF6O75683 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF6O75683 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF6O75683 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF6O75683 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF6O75683 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF6O75683 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF6O75683 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF6O75683 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms