Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF40O75150 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RNF40O75150 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RNF40O75150 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF40O75150 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF40O75150 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF40O75150 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF40O75150 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF40O75150 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF40O75150 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF40O75150 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF40O75150 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF40O75150 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF40O75150 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF40O75150 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF40O75150 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF40O75150 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF40O75150 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF40O75150 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF40O75150 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF40O75150 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF40O75150 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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