Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSPNO60542 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSPNO60542 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSPNO60542 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSPNO60542 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSPNO60542 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSPNO60542 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSPNO60542 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPNO60542 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms