Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIAA0556O60303 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms