Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA5O60264 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA5O60264 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms