Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCO2O43819 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCO2O43819 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCO2O43819 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCO2O43819 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCO2O43819 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCO2O43819 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCO2O43819 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCO2O43819 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCO2O43819 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCO2O43819 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCO2O43819 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCO2O43819 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCO2O43819 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCO2O43819 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCO2O43819 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCO2O43819 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SCO2O43819 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCO2O43819 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCO2O43819 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCO2O43819 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCO2O43819 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SCO2O43819 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCO2O43819 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCO2O43819 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCO2O43819 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCO2O43819 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SCO2O43819 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SCO2O43819 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCO2O43819 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCO2O43819 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCO2O43819 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCO2O43819 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCO2O43819 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCO2O43819 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCO2O43819 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCO2O43819 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCO2O43819 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCO2O43819 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCO2O43819 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCO2O43819 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCO2O43819 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCO2O43819 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCO2O43819 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCO2O43819 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCO2O43819 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCO2O43819 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCO2O43819 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCO2O43819 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCO2O43819 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms