Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRRTM2O43300 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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