Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC7A4O43246 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC7A4O43246 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms