Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms