Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMAPO00193 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMAPO00193 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMAPO00193 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAPO00193 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAPO00193 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAPO00193 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAPO00193 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAPO00193 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAPO00193 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAPO00193 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAPO00193 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAPO00193 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAPO00193 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAPO00193 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAPO00193 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAPO00193 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAPO00193 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAPO00193 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAPO00193 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAPO00193 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAPO00193 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAPO00193 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAPO00193 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAPO00193 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAPO00193 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAPO00193 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAPO00193 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAPO00193 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAPO00193 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAPO00193 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAPO00193 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAPO00193 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAPO00193 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAPO00193 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAPO00193 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAPO00193 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAPO00193 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAPO00193 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAPO00193 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAPO00193 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAPO00193 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAPO00193 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAPO00193 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAPO00193 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAPO00193 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAPO00193 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAPO00193 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAPO00193 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAPO00193 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAPO00193 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAPO00193 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms