Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L21D6R901 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms