Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms