Protein–RNA interactions for Protein: A8MRT5

NPIPB5, Nuclear pore complex-interacting protein family member B5, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB5A8MRT5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB5A8MRT5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB5A8MRT5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB5A8MRT5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB5A8MRT5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPIPB5A8MRT5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms