Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms