Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRIQ3A6PVS8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ3A6PVS8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ3A6PVS8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ3A6PVS8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ3A6PVS8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRIQ3A6PVS8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ3A6PVS8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ3A6PVS8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ3A6PVS8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ3A6PVS8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ3A6PVS8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ3A6PVS8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ3A6PVS8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ3A6PVS8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRIQ3A6PVS8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms