Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85CA6NKD9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms