Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSC5DA1L4H1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSC5DA1L4H1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms