Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 NFU1P1-201ENST00000413128 774 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 HNRNPA1P30-201ENST00000424329 751 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 ARPP21-217ENST00000436702 561 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC011498.1-203ENST00000589066 359 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AL450384.2-202ENST00000436485 656 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 RPL6P24-201ENST00000445338 864 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 LNX1-AS2-202ENST00000509974 628 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 BLNK-203ENST00000413476 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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