Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC092167.1-201ENST00000435466 495 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC008677.3-201ENST00000519146 666 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC110741.1-201ENST00000520149 582 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC090826.1-201ENST00000564109 915 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 LINC02544-201ENST00000564830 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC005154.1-225ENST00000581665 564 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC010980.1-204ENST00000589724 585 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 Z98949.1-208ENST00000597614 816 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC087623.4-201ENST00000606593 695 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AL359745.1-201ENST00000626943 760 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 FGL2-202ENST00000637771 989 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC119674.1-209ENST00000642031 997 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 GPM6B-210ENST00000493677 1372 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 CCL13-201ENST00000225844 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 ORM1-201ENST00000259396 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 PHF6-203ENST00000370800 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 RNA5SP23-201ENST00000391006 105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 VDAC1P8-201ENST00000406025 853 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 RBMY2GP-201ENST00000418671 1034 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 FTH1P5-201ENST00000425761 545 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 RBMY2NP-201ENST00000434454 1028 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 ZBTB20-AS4-201ENST00000472323 675 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 NDUFS5P2-201ENST00000484004 306 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 UBE2CP1-201ENST00000557130 554 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC244090.2-201ENST00000567614 792 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC093074.1-201ENST00000590280 556 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AL583859.2-202ENST00000602311 505 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC140658.6-201ENST00000603958 201 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC073389.2-201ENST00000606726 571 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AC006449.1-201ENST00000616263 571 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 TTN-AS1-265ENST00000627661 806 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AP000766.1-201ENST00000561746 4140 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SHEQ5VZ18 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms